В связи с реализацией в mkvmerge v4.1.0 части стандарта контейнера Matroska, именуемой «header removal compression», на некоторых железных и софтовых плеерах, не полностью поддерживающих стандарт, появились проблемы с воспроизведением контейнера MKV.
Для проведения сборки контейнера понадобится MKVtoolnix — это набор бесплатных программ для работы с медиа контейнером Matroska (mkv/mka файлы, по-русски известен как «Матрёшка»). Набор утилит MKVtoolnix совершенно бесплатен и доступен для разных платформ (Windows, Linux и его клоны, разные *nix’ы, MacOS). Скачать последнюю версию можно с официального сайта.